Tiền thân là Trung Tâm Y Tế Quận Ngô Quyền, đến 15/06/2007 đã được tách ra thành Bệnh Viện Đa Khoa Ngô Quyền . Tháng 12/ 2008 Bệnh viện được thẩm định và nâng hạng bệnh viện từ hạng III lên hạng II. Hiện tại, bệnh viện đã có nhiều thay đổi, đạt được những thành tích đáng kể trong công tác bảo vệ, chăm sóc, điều trị và nâng cao sức khỏe cho bệnh nhân, nhân dân trên địa bàn quận Ngô Quyền và trong thành phố.
Dưới sự chỉ đạo sáng suốt và năng động của tập thể ban chấp hành Đảng ủy, ban giám đốc, trong nhiều năm qua, bệnh viện đã tạo dựng được thương hiệu, là địa chỉ tin cậy của đông đảo bệnh nhân, nhân dân đến khám và điều trị bệnh. Hàng năm bệnh viện khám, điều trị hàng chục nghìn lượt bệnh nhân, luôn đạt và vượt chỉ tiêu kế hoạch. Cấp cứu nhiều ca bệnh hiểm nghèo, đảm bảo đơn vị an toàn hợp lý về thuốc, hạn chế tối đa không để xảy ra tai biến chuyên môn.
Từ năm 2018, sự phát triển của bệnh viện diễn ra trong bối cảnh ngành y tế cả nước bắt đầu thực hiện tự chủ nguồn kinh tế theo tinh thần Nghị quyết Trung ương 6 khóa XII. Khó khăn và thuận lợị đan xen đặt ra với bệnh viện những yêu cầu và thách thức mới, nhưng tập thể cán bộ, viên chức, lao động bệnh viện quyết tâm phấn đấu, hoàn thành nhiệm vụ và chỉ tiêu kế hoạch ngay từ đầu năm. Bệnh viện đã quán triệt và triển khai kế hoạch số 1450/ KH-BYT ngày 29/12/2017 của Bộ y tế về “Học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh; Thực hiện quy chế dân chủ cơ sở; Quy tắc ứng xử, đổi mới phong cách, thái độ phục vụ của cán bộ y tế; xây dựng cơ sở y tế “Xanh-Sạch-Đep”.
Hiện tại bệnh viện Đa Khoa Ngô Quyền có 227 cán bộ viên chức lao động, với 162 biên chế. Công suất giường bệnh 160,với 21 khoa, phòng. Đội ngũ trưởng khoa, phòng đều có trình độ sau đại học. Ban giám đốc có 2/3 bằng bác sĩ chuyên khoa cấp II, 1/3 bằng bác sĩ chuyên khoa cấp I. Với đội ngũ y bác sĩ tận tâm, có chuyên môn tốt, cơ sở vật chất ngày càng được cải thiện, đổi mới; Trang thiết bị y tế được đầu tư, nâng cấp đáp ứng thực hiện được các kỹ thuật y tế chuyên sâu. Bệnh viện đa khoa Ngô Quyền là địa chỉ tin cậy để nhân dân, bệnh nhân chọn lựa là nơi chăm sóc , điều trị và nâng cao sức khỏe.